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视黄酸对人巩膜成纤维细胞基因表达的影响
作者:曾骏文  …  文章来源:中山大学中山眼科中心 510060  点击数958  更新时间:2006/6/28 10:18:43  文章录入:may72  责任编辑:毛进
目的:利用基因芯片技术筛选视黄酸(RA)培养人巩膜成纤维细胞(HSF)后相关基因群的表达变化,研究RA作用于HSF的相关通路,探讨近视眼发病的巩膜机制。方法:HSF传代至第四代后以1×106的密度接种于25cm2的培养瓶,以含10%FBS的DMEM/F12培养液培养24小时后,培养液转换为含浓度为1×10-5M RA的DMEM/F12,以未加RA组作正常对照,继续培养48后用Trizol一步法提取细胞中的总RNA,对样品RNA进行荧光标记,通过杂交与清洗,对标记的人类全基因组寡核苷酸芯片进行扫描,采用图像分析软件对芯片图像进行分析,把图像信号转化为数字信号,然后对芯片上的数据用Lowess方法进行归一化,最后以差异为两倍的标准来确定差异表达基因。结果:在用1×10-5RA培养HSF48小时后,人类全基因组寡核苷酸芯片的21571个基因共有562个基因表达有差异。其中运输36、转录调控30、信号60、逆境反应25、代谢133、发育67、细胞组织与生物发生15、细胞运动18、分化3、细胞周期25、细胞粘连31、细胞凋亡15个基因表达有差异。细胞外基质的富含亮氨酸的蛋白多糖分子均下调,细胞凋亡基因大部分上调,TGFβ通路基因大部分下调。结论:RA通过多条信号通路对HSF发生作用,RA在HSF的形态变化与功能维持中发挥了重要作用。关键词:视黄酸,人巩膜成纤维细胞,基因芯片
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