目的:分析角膜铜绿假单胞菌Mult Locus Sequences Typing(MLST)基因型,探讨基因型的特点
方法:转种培养23株角膜铜绿假单胞菌,提取菌株的DNA。应用MLST官方网站(www.pubmlst.org)提供的特异性引物,PCR扩增7个看家基因内部的部分DNA序列,扩增产物测序后,提交MLST网站与相应基因的等位基因进行比较。每个看家基因的等位基因中有1个与测序结果一致,获得该菌株针对7个看家基因的等位基因谱,最后确定分离株的序列分型。应用START软件,采用UPGMA法建立进化树。探讨基因型特点。
结果:23株细菌可分为20个基因型。聚类后分为Ⅰ、Ⅱ2个类群。20株细菌在Ⅰ类群(87%),3株细菌在Ⅱ类群。Ⅰ类群又可分为ⅰ、ⅱ、ⅲ亚群。ⅱ亚群中的菌株数最多,为16株,占Ⅰ类群的87%。ⅱ亚群中最大的两个子亚群A,B。A子亚群中有6株细菌,占ⅱ亚群的37.5%;B子亚群有8株细菌,占ⅱ亚群的50%。
结论:角膜分离的铜绿假单胞菌MLST基因型较为分散,本实验23株细菌的同源性较好 |