| 目的：明确北方两地区小学生沙眼患者病原体的基因类型。
方法：按照世界卫生组织（WHO）沙眼分期标准（1987），在宁夏回族自治区银川市和河北省武强县两地采集临床诊断为沙眼的小学生结膜样本共213份。利用聚合酶链反应（PCR）检测沙眼衣原体质粒片段，对质粒PCR检测阳性者通过套式PCR反应扩增沙眼衣原体主要外膜蛋白基因（omp1）第4可变区片段（VS4），扩增产物直接测序后，采用分子生物学软件Clustal X和MEGA2进行分析，分析本研究沙眼衣原体株基因特点及其与我国及其他国家或地区保存株之间的异同。
结果: 1）银川市45份样本中，质粒PCR检测阳性22份，检出率为48.9%；对17份样本进行套式PCR基因分型，显示B型为16份（94.1%），C型为1份（5.9%）。2）武强县168份样本中，质粒PCR检测阳性109份，检出率为64.9%；对武强县34份样本进行分型，28份(82.4%)为B型，6份(17.6%)为C型。3）根据序列对比结果，利用MEGA2软件Kimura 2-parameter 计算方法，进行1000次bootstrap统计学检验，本研究中51份B型及C型沙眼衣原体同型之间同源性强，而与A型、D型、E型及L2型沙眼衣原体基因序列有很大的差异。
结论：北方地区武强县和银川市的小学生中，流行性沙眼的病原体基因类型为B型和C型，以B型为主。通过聚类分析发现，武强县和银川市小学生沙眼患者病原体与其他国家及地区同类型的沙眼衣原体保存株的基因序列高度同源性。
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