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蛋白质组学技术筛选人脉络膜黑色素瘤相关蛋白
作者:康媚霞  文章来源:北京市东交民巷1号北京同仁医院眼科中心  点击数1561  更新时间:2008/2/15  文章录入:毛进  责任编辑:毛进
蛋白质组学技术筛选人脉络膜黑色素瘤相关蛋白
康媚霞,魏文斌,史雪辉,田蓓
首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心(北京市东交民巷1号同仁医院眼科中心,100730)
目的:建立人脉络膜黑色素瘤蛋白质表达谱,筛选人脉络膜黑色素瘤肿瘤相关蛋白。
方法:标本来自手术局部切除的经病理证实的5例脉络膜黑色素瘤。提取肿瘤组织蛋白,通过双向凝胶电泳得到人脉络膜黑色素瘤胶图。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对胶内酶切得到的蛋白质点进行分离、鉴定,MASCOT 软件(版本2.2)在NCBI nr数据库中检索蛋白质信息,建立人脉络膜黑色素瘤蛋白质组学蛋白质表达谱。
结果:共鉴定出238个蛋白质,主要执行新陈代谢、信号转导、酶、信号调节、细胞骨架、免疫和离子通道等生物学功能,其中与新陈代谢相关蛋白质的变化最为明显。其中60种蛋白与肿瘤相关,约50%定位于细胞质,其余分布在线粒体、细胞核。
结论:本研究表明通过蛋白质组学分析,可以初步筛选出与脉络膜黑色素瘤肿瘤相关的蛋白。需要进一步验证、筛选肿瘤标志物。
关键词:脉络膜黑色素瘤,蛋白质组学,肿瘤标志物
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