数字化差异筛选及鉴定视网膜母细胞瘤肿瘤相关性基因
朱益华，阳菊华，赵建军，林建银，马旭
福建医科大学附属第一医院眼科：福建省福州市茶中路20号；350005
目的 利用肿瘤基因组解剖计划(CGAP)数据库进行数据挖掘，筛选视网膜母细胞瘤（RB）差异表达基因，初步鉴定RB发生/发展过程中的肿瘤相关性候选基因。
方法 采用数字化基因差异显示（DGEG）工具对CGAP数据库中的RB和正常视网膜组织的EST文库与SAGE文库进行分析，筛选差异表达基因，及通过 iHOP分析建立肿瘤候选基因与RB之间的关联；随后，利用实时定量RT-PCR和组织芯片-免疫组化鉴定RB肿瘤候选基因的mRNA与蛋白表达水平。
结果：共筛选出260个差异表达基因。基因功能分类分析结果显示：差异表达谱较好揭示了RB的生物学及生化特征。Northern Blot及组织芯片-免疫组化验证了几个候选基因，iHOP分析这些候选基因与RB的发生/发展相关联。这些结果也暗示MCM7和WIF1可作为一个有潜在前景的治疗RB的靶基因。
结论 利用生物信息学工具可以有效而快速筛选RB差异表达基因，为研究RB发生机制及RB的临床诊断和治疗提供新的参考依据。
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