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真菌性角膜炎分离镰孢霉的基因鉴定与形态学鉴定比较
作者:孙声桃  文章来源:河南省眼科研究所 河南省角膜病重点实验室  点击数361  更新时间:2011/9/13  文章录入:毛进  责任编辑:毛进
目的 通过对真菌性角膜炎分离镰孢菌分子生物学鉴定,来评价形态学鉴定的作用和效果,以基因鉴定的结果来提高形态学鉴定的准确性。
方法 真菌性角膜炎分离的真菌,参照《常见常用真菌》、《真菌鉴定学》形态学鉴定为镰孢霉属的真菌,葡萄糖马铃薯培养基35℃培养一周,收集菌丝,提取DNA后,PCR扩增翻译延长因子(TEF)1-α基因后,测序,登陆http://fusarium.cbio.psu.edu/比对,获得基因鉴定的菌种结果。
结果 形态学鉴定为镰孢霉属真菌575株,72株阴性(12.52%)。形态学鉴定为腐皮镰孢菌复合体(FSSC)最多,382株,TEF1-α鉴定为:阴性53株(13.87%),FSSC 286株,准确率74.87%,其余F proliferatum(5.26%),   F verticilliodes(3.66%)。形态学鉴定为燕麦镰孢菌85株,TEF1-α鉴定为:阴性12株,14.12%,F verticilliodes41株(48.24%),GFSC 5株(5.88%),F proliferatum 21株(24.71%),FSSC3株(3.53%)。形态学鉴定为串珠镰孢菌52株,F proliferatum22株(42.31%),F verticilliodes16株(30.77%),GFSC 5株(9.62%)。形态学鉴定为尖孢镰孢菌20株,2株阴性,FSSC18株(90%)。培养中未见厚垣孢子的直喙镰孢菌,木贼镰孢菌,拟分隔镰孢菌多为串珠镰孢菌,即F verticilliodes和 GFSC。
结论 形态学鉴定对于镰孢菌的鉴定,存在较大的误差,对于常见的FSSC,有相对较准确的鉴定;对于其他类型的真菌需要在基因鉴定之后来为形态学鉴定提供指导。
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