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家族性角膜营养不良基因定位及TGFBI基因序列分析
作者:陈静  文章来源:深圳市眼科医院  点击数269  更新时间:2012/9/13  文章录入:毛进  责任编辑:毛进
目的 应用连锁分析、基因测序的方法,对一个常染色体显性遗传的角膜营养不良家系进行基因筛查及定位,探讨该家系的发病原因。
方法 收集一个中国人Thiel-Behnke蜂窝状角膜营不良家系,共428人,其中患者10人,10 岁前即可发病,男女比例11,对入选对象进行详细的临床检查。连锁分析:抽取其中18人外周血提取DNA,利用ABI PRISM® Linkage Mapping Set version 2.5试剂盒及针对TGFBI基因自行选择合成的STR 标记,经聚合酶链反应扩增后,通过ABI 3130xl全自动遗传分析仪确定等位基因分型,利用LINKAGE软件进行两点间连锁分析,计算LOD值,并构建单体型。基因序列分析:对所有家系患病成员及正常同胞进行TGFBI基因编码序列分析,包括其全部17个外显子,5’及3’端与外显子拼接的内含子序列。
结果 经连锁分析得出五个STR 标记D5S816~D5S1500LOD>3,其中与TGFBI基因相邻的D5S399(θ=0)取得最大值为4.81单体型分析发现该家系角膜营养不良表型与D5S816~D5S1500等位基因片段存在共分离现象,定位该家系致病基因位于5q31上一4.37cM区间内。在此区间内的候选基因TGFBI与角膜营养不良的发病相关。对TGFBI基因直接测序显示家系中所有患者在TGFBI基因的第2外显子存在杂合性突变,mRNA370位碱基出现CT的杂合性碱基改变,导致了野生型基因编码的精氨酸(ArginineArgR)被胱氨酸(CystineCysC)替代,使密码子R124C发生了突变,并且该突变与疾病表型共分离。
结论 发现了一个常染色体显性遗传的角膜营养不良家系,其致病基因位点定位于5q31上一4.37cM区间内。经序列分析确定该家系角膜营养不良患者均存在TGFBI基因第2外显子的R124C突变。
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