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固相杂交快速检测真菌性角膜病常见致病菌种的初步研究
作者:张英朗 王…  文章来源:河南省眼科研究所  点击数1091  更新时间:2005/6/14 15:11:38  文章录入:zhangyl  责任编辑:毛进
目的 建立一种采用固相杂交技术对真菌性角膜病常见致病菌种进行快速、准确检测和鉴定的实验方法。方法 根据流行病学调查,对5属10种真菌性角膜病常见致病菌(腐皮镰孢菌、串珠镰孢菌、梨状镰孢菌、烟曲霉菌、黄曲霉菌、黑曲霉菌、土曲霉菌、新月弯孢菌、牵连青霉菌、白色念珠菌)标准菌株,异硫氰酸胍裂解法提取样本DNA。 应用基因序列比对和引物设计软件,筛选设计一对通用引物,对下游引物进行5′端TAMRA荧光标记。在同一PCR 反应体系中,对上述真菌含部分18S、全部ITS1、5.8S、ITS2和部分28SrDNA的基因片断进行扩增,在GenBank 进行BLAST查询,选取该区域内特异性最好的寡核苷酸序列合成探针,并进行3′端氨基化修饰。将10种真菌相关探针点样于醛基化载玻片上,在探针排列的载玻片区域加入杂交反应液和PCR扩增产物进行杂交,置于荧光显微镜下观察显色情况。结果 通过琼脂糖凝胶电泳观察,10种真菌都产生了约为340-410bp 的PCR扩增产物,在相同的条件下对其进行杂交检测,得到了具有各自特征的杂交后荧光显色图谱,通过荧光信号可直接从杂交显色图谱上对不同菌种区分判断。结论 采用荧光标记的通用引物,通过不对称PCR扩增,产生带有荧光标记的扩增产物,以醛基化玻片为载体,与特异性寡核苷酸探针固相杂交,能够在3-4小时内完成对我国临床上常见的10种角膜致病真菌的菌种鉴定。
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