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人小梁网ESTs和青光眼基因的生物信息学分析
作者:张艳莉 马…  文章来源:中山大学中山眼科中心  点击数1522  更新时间:2005/6/19 12:56:19  文章录入:zyl820  责任编辑:毛进
目的 用生物信息学方法分析人小梁网的表达序列标签(ESTs)和人类青光眼相关基因。材料和方法 人类小梁网的ESTs和青光眼相关基因分别由NEIBank数据库和NCBI的GENE数据库获得。经EMBL数据库中查找小梁网ESTs的相关功能,并将它们按功能分类;将GENE数据库中查询青光眼基因的相关信息进行整理,总结它们的位点、功能、相关疾病以及家系调查,并经CDD对序列进行比较分析,找出与青光眼基因中部分序列相匹配的小梁网ESTs。结果 NEIBank数据库中收录的小梁网ESTs共有626条,其中已经被鉴定出来的ESTs有414条。这些已鉴定了的ESTs按功能主要分为17类,其中与代谢、转录、翻译、修饰、细胞信号、免疫相关的ESTs数量较多。也包括一定数量的与细胞周期、细胞调亡等相关的ESTs;已报道的人类青光眼基因共25个,其中有5个青光眼基因含有与小梁网的ESTs相匹配的序列。结论 通过对正常小梁网ESTs和青光眼基因的总结和比较分析,有助于全面了解小梁网的基因表达并阐明青光眼的发生机制。
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