| 生物样品是否需要进行纯化处理,以及对纯化程度的要求,取决于使用的测定方法和生物样品所含杂质的情况。在生物药物分析中，仅少数情况下可取样品直接测定，对于大多数样品及一般分析方法而言，进行样品预处理是必要的。如测定前样品的均匀化、去蛋白处理、及结合物水解等。在这里着重介绍生物样品测定前的去蛋白与萃取。
生物样品如血浆、血清、粪便及唾液等含有大量的蛋白质，它们能结合药物，因此，对于某些药物的测定，必须先将与蛋白质结合的药物游离之后再作进一步处理（如萃取）。测定血液、尿液及脑脊液等液体中的药物时因这些体液中含有蛋白质，在测定过程中会形成泡沫、浑浊或出现沉淀而干扰测定；在某些测定过程中，蛋白质本身会同测定试剂起反应；用反相高效液相层析来进行分析（hplc），虽然可以直接进样，但液体中的蛋白质（以及脂类、盐类和其它内源性杂质）会沉淀在层析柱上。
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