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眼部奴卡菌的基因型及种间分布研究         
眼部奴卡菌的基因型及种间分布研究
作者:殷晓棠  … 文章来源:100005 北京,首都医科大学附属北京同仁医院眼科中心 北京市眼科研究所 点击数:1252 更新时间:2007/5/23 9:03:12
【摘要】目的 利用hsp65序列片段对眼部分离奴卡菌进行种、属间鉴定,并探讨眼部分离奴卡菌的种间分布。 方法 分离转种培养眼部分离11株奴卡菌(形态学鉴定),应用属特异性引物扩增部分hsp65序列片段,利用Mega Blast软件,将扩增序列与GenBank中的标准序列进行比对,并使用Clustal W软件[4],基于接邻法构建有根进化树,以分析眼部分离奴卡菌的种间分布。 结果 11株奴卡菌hsp65序列片段与GenBank数据库的序列比较显示了高达98.7% 到100%序列相似性,并分别属于六个种:N. arthritidis, (3/11), N. neocaledoniensis (3/11), N. asiatica (2/11), N. asteroids Ⅳ (1/11), N. brasiliensis (1/11) 以及 N.pseudobrasiliensis (1/11)。 N. arthritidis是最常见的角膜炎致病菌种,N. neocaledoniensis首次被分离自结膜囊。 结论 由奴卡菌属特异性引物扩增的hsp65序列片段能提供足够的分辨率,以快速准确地区分关系较近的奴卡菌种及相关属,是临床和实验室诊断重要的辅助手段;基于基因学和系统发生学探讨的眼部分离奴卡菌菌种的多样性对深入研究其致病机制以及抗生素敏感性有重要的临床意义;N. arthritidis是最重要的眼部致病奴卡菌菌种。
会议投稿录入:liangqingfeng    责任编辑:毛进 
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