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新一代高通量基因捕获测序技术在多种遗传性视网膜疾病中的研究综合分析           ★★★
新一代高通量基因捕获测序技术在多种遗传性视网膜疾病中的研究综合分析
作者:赵晨 文章来源:江苏省人民医院 点击数:298 更新时间:2012/9/13
 

目的:遗传性视网膜疾病(HRDs)是以视网膜退化进程不可逆为特征的一组广泛的疾病。HRDs具有显著的遗传和临床异质性,这对传统技术在大量候选基因中确定引起HRDs的突变是一个挑战。

方法:我们设计了一种高通量基因捕获测序技术以提高HRDs的高效分子诊断平台,目标为179个已知的HRDs相关基因和10个预测基因的外显子区域和外显子内含子交界区域。我们应用以深度测序为平台的靶基因捕获芯片技术对患有多种HRDs24个家系进行了新一代的测序。

结果:基于以Sanger测序验证和潜在病因学分析优化的生物信息学分析,我们快速确定了4个已知突变,12个新突变,包括错义突变,无义突变,小片段缺失,剪切位点突变和移码突变。这使我们在1666.7%】个家系中得出明确的基因诊断,在4个家系中仍有12个很有可能致病的突变,这需要深入的研究。值得指出的是,在一个具有相当复杂表型的家族中,一个VCAN基因突变的确证帮助我们最终确定了临床诊断,为Wanger综合征。

结论:我们的结果不仅显著地拓宽了HRDs基因突变的检测范围,也证明了我们所描述的方法是一个强有力的,符合成本效益的诊断工具,可以同时在多种HRDs中检测突变,并具有潜在的临床实践意义。

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