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全基因组外显子测序确诊罕见的双基因突变导致一中国家系发生晶体半脱位和严重骨骼畸形的复杂疾病           ★★★
全基因组外显子测序确诊罕见的双基因突变导致一中国家系发生晶体半脱位和严重骨骼畸形的复杂疾病
作者:盛迅伦 文章来源:宁夏人民医院 点击数:275 更新时间:2012/9/13

目的: 一个中国家系,先证者表现为双眼晶体半脱位和先天性心脏病,同时与其哥哥和母亲一样表现出严重骨骼畸形和身材矮小;另外其母亲因严重的骨痛和肌肉萎缩行走困难。本研究采用全基因组外显子测序技术筛查致病性基因,明确临床诊断。

方法:收集家系成员外周静脉血,提取基因组DNA。进行外显子捕获和高通量测序,将得到的基本数据进行分析处理,经过SNP筛选,得到候选的致病基因。用PCR测序技术在家系中进行候选致病基因分析,检测基因型与表型的共分离,确定致病性突变位点。同时以100例无血缘关系的正常人作为对照。应用5种网络软件(PolyPhen-2, SIFT, PANTHER, Pmut and Align-GVGD),评价突变导致的氨基酸改变在蛋白结构和功能上的生物学作用。所有患者均经过详细的眼科临床检查、 血生化检查、X-ray检查。

结果:在先证者发现178个遗传变异,在3名患者发现57种相同的变异,通过与公共数据库比对过滤分析,在先证者FBN1基因发现一个新的C792F错义突变,FBN1基因是导致Manfan氏综合症的相关基因。另外,在三名患者PHEX基因上发现R291X无义突变,PHEX基因是导致遗传家族性抗维生素D佝偻病的相关基因。 2个突变均与表型共分离。评估软件分析提示C792FR291X为致病性突变。家系的正常成员和100名正常人中未发现这两个突变。先证者及哥哥和母亲血碱性磷酸酶(U/L)分别为589,337, 69(正常值42-140 U/L);血P3+(mmol/L):0.92,0.91,0.79(正常值0.8-2.26 mmol/L)

结论 :本研究中先证者出现眼、心脏和骨骼多脏器的病变的原因是由于FBN1PHEX双基因发生了突变,导致先证者发生Manfan氏综合症和家族性抗维生素D佝偻病两种遗传性疾病。PHEX基因上发现的R291X无义突变是导致先证者哥哥和母亲发生家族性抗维生素D佝偻病和骨软化症的致病原因。研究结果表明基因突变的检测对复杂疾病的诊断具有十分重要的意义。






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